Suara.com - Di tengah kekhawatiran akan gelombang ketiga virus corona karena meningkatnya kasus varian Omicron, jenis baru Covid-19 telah terdeteksi di Prancis.
Peneliti Prancis pada hari Selasa melaporkan varian baru, mungkin berasal dari Kamerun. Mereka untuk sementara menamakannya 'IHU'.
Varian baru ini dari garis keturunan bernama B.1.640.2 diyakini telah menginfeksi 12 orang di negara itu, menurut studi peer-review yang didukung oleh Pemerintah Prancis.
Ini memiliki 46 mutasi dan 37 penghapusan.
“Untuk dua belas pasien positif SARS-CoV yang tinggal di wilayah geografis yang sama di tenggara Prancis, pengujian qPCR yang menyaring mutasi terkait varian menunjukkan kombinasi atipikal,” kata Philippe Colson, dari IHU Mediterranee Infection, Marseille, Prancis.
Namun, "terlalu dini untuk berspekulasi tentang fitur virologi, epidemiologi, atau klinis dari varian IHU ini berdasarkan 12 kasus ini," kata Colson.
Menurut penelitian, kasus indeks (pasien pertama) adalah orang dewasa yang divaksinasi yang telah kembali ke Prancis dari perjalanan ke Kamerun, di Afrika tengah.
Tiga hari setelah kembali, dia mengalami gejala pernapasan ringan. Sampel nasofaringnya dikumpulkan pada pertengahan November 2021, "mengungkapkan kombinasi atipikal yang tidak sesuai dengan pola varian Delta yang terlibat dalam hampir semua infeksi SARS-CoV-2 pada waktu itu", dan kemudian ke Omicron juga, kata Colson.
Sampel pernapasan yang dikumpulkan dari tujuh pasien positif SARS-CoV-2 lainnya yang tinggal di wilayah geografis yang sama menunjukkan kombinasi mutasi yang sama yang disaring oleh qPCR. Mereka adalah dua orang dewasa dan lima anak-anak (di bawah usia 15 tahun).
Sampel pernapasan dari delapan pasien ini dikirim ke institut rumah sakit universitas Mediterranee Infection untuk pengurutan genom SARS-CoV-2 seperti yang direkomendasikan oleh otoritas kesehatan masyarakat Prancis.
Tes lebih lanjut mengarah pada identifikasi genotipe SARS-CoV-2. Analisis mengungkapkan 46 mutasi dan 37 penghapusan menghasilkan 30 substitusi asam amino dan 12 penghapusan. Empat belas substitusi asam amino, termasuk N501Y dan E484K, dan 9 delesi terletak di protein spike.
"Pola genotipe ini menyebabkan terciptanya garis keturunan Pangolin baru bernama B.1.640.2, yang merupakan kelompok saudara filogenetik dari garis keturunan B.1.640 lama yang berganti nama menjadi B.1.640.1. Kedua garis keturunan itu berbeda dengan 25 substitusi nukleotida dan 33 penghapusan," kata studi itu.
"Set mutasi dan posisi filogenetik genom yang diperoleh di sini menunjukkan, berdasarkan definisi kami sebelumnya, varian baru yang kami beri nama 'IHU'," kata Colson.
Dia menambahkan bahwa data tersebut adalah "contoh lain dari ketidakpastian munculnya varian SARS-CoV-2".
"Secara keseluruhan, pengamatan ini menunjukkan sekali lagi ketidakpastian munculnya varian baru SARS-CoV-2 dan pengenalannya dari luar negeri, dan mereka menunjukkan kesulitan untuk mengendalikan pengenalan tersebut dan penyebaran selanjutnya," kata Colson.
“Varian SARS-CoV-2 telah menjadi perhatian virologi, epidemiologi, dan klinis utama, terutama berkaitan dengan risiko lolos dari kekebalan yang diinduksi vaksin. Munculnya varian baru menjamin peningkatan pengawasan genomik SARS-CoV-2 ," dia berkata.
TERPOPULER
