Di antaranya ialah Labuan Bajo, yang terletak di bagian paling barat Pulau Flores, terkenal dengan pemandangan matahari terbenam dan margasatwanya, termasuk Komodo yang dapat diamati di Taman Nasional Komodo.
Adapula Lombok, yang kini mendapatkan lebih banyak wisatawan berkat sirkuit Mandalika dan infrastruktur baru lainnya. Di kepulauan Gili, penyelam dapat menikmati titik penyelaman terpopuler seperti Shark Diving (Trawangan Barat), Turtle Diving, Drift Diving, Wreck Diving (Wreck kapal patroli Jepang pada Perang Dunia II) dan tentu saja Muck Diving untuk para fotografer bawah air.
Tak ketinggalan Likupang, yang dapat ditempuh sekitar 1,5 jam dari Manado, adalah permata tersembunyi yang hanya diketahui oleh para penyelam. Dive center dan resort di pulau-pulau kecil lepas pantai Likupang sangat disukai oleh penyelam internasional.