Belum genap dua tahun menjabat sebagai Rektor UGM, Pratikno pun dipanggil dan diamanahkan oleh Presiden Jokowi untuk menjabat sebagai Menteri Sekretaris Negara (Mensesneg) periode 2014 - 2019 dalam Kabinet Kerja Jokowi - JK.
Saat Jokowi kembali terpilih sebagai presiden bersama wapres Ma'ruf Amin dalam pilpres tahun 2019 lalu, nama Pratikno kembali dipanggil Jokowi untuk menjabat sebagai Mensesneg kembali periode 2019-2024 dalam Kabinet Indonesia Maju.
Kontributor : Dea Nabila