Keduanya menikah sejak 2004 dan telah dikaruniai dua orang anak, anak pertamanya Atqiya Maulana Habiburrohman yang lahir pada 7 Agustus 2006 dan anak keduanya Mufti Nabil Ulayya Mecca yang lahir pada 20 September 2015.
Ning Astuti kini fokus mengelola Pondok Pesantren Ora Aji yang berlokasi di Yogyakarta bersama yang suami Gus Miftah. Pondok Pesantren Ora Aji Yogyakarta sendiri didirikan oleh Gus Miftah pada tahun 2011.
Ning Astuti sendiri bertugas menemani sang suami yang berdakwah dan juga menjadi pengajar di Pondok Pesantren tersebut. Sayangnya aktivitas mengajarnya sempat terhenti saat dirinya terkena kanker dan harus dirawat di rumah sakit.
Ning Astuti juga aktif di media sosial, akun Instagram miliknya @bunda_gus_atqi_ning_mecca_ bahkan sudah diikiti lebih dari 49 pengikut.
Dalam beberapa unggahanya, Ning Astuti menampakan sisi lain dari seorang istri kyai. Ning Astuti rupanya pandai mengendarai motor besar.