Seiring dengan bergulirnya musim serta kompetisi domestik dan Eropa, badai cedera pemain kerap melanda Real Madrid.
Bahkan Zidane pernah kehilangan enam hingga tujuh pemain kunci sejumlah pertandingan krusial. Akan tetapi, Zidane yang ketika itu kerap mengambil empat pemain muda dari Castilla besutan Raul Gonzalez, berhasil memenangi pertandingan.
Di tengah keterbatasan tersebut, Zidane berhasil membawa Real Madrid finis di posisi dua klasemen akhir La Liga dengan 84 poin. Madrid hanya tertinggal dua poin dari sang juara Atletico, yang di musim panas 2020 berbenah dengan mendatangkan sejumlah pemain hebat, termasuk Luis Suarez dari Barcelona.
Di Liga Champions, Real Madrid berhasil tampil di babak semifinal. Meski mereka akhirnya disingkirkan Chelsea dengan agregat 3-1.