Bagian kedua dari siklus menstruasi dimulai dengan fase luteal di ovarium. Kantung yang berisi sel telur menghasilkan estrogen dan progesteron yang menyebabkan perubahan mood, sakit kepala, jerawat, kembung dan nyeri payudara.
Jika sel telur dibuahi sperma selama fase ini, progesteron akan mendukung kehamilan. Jika sel telur tidak dibuahi, maka korpus luteum akan rusak antara 9 dan 11 hari selama ovulasi. Tingkat estrogen dan progesteron juga akan turun.
Fase sekresi berikutnya terjadi dari ovulasi hingga awal menstruasi. Lapisan rahim melepaskan atau mengeluarkan bahan kimia untuk membantu sel telur yang telah dibuahi menempel atau membantu lapisan tersebut rusak jika tidak terjadi pembuahan.
Pada masa ini, kadar progestron akan meningkat dan menyebabkan kram. Lalu, menstruasi akan terjadi kembali.