Diketahui, Sophia Latjuba telah dua kali menikah namun hubungannya selalu kandas. Dia menikah pertama kali dengan Indra Lesmana pada tahun 1992 dan memiliki anak Eva Celia. Tetapi pernikahan mereka hanya bertahan satu tahun.
Kemudian Sophia Latjuba kembali menikah dengan seorang pria berkebangsaan Amerika Serikat bernama Michael A. Villarreal pada 2005. Dari pernikahan tersebut keduanya memiliki anak Manuella. Tetapi Sophia Latjuba kembali bercerai pada 2014 dan memutuskan tidak lagi menikah sampai sekarang.