Sayangnya hanya bertahan setahun, pada 2018 Jan Saragih pindah dari kepelatihan Persija untuk menjadi Pelatih Kepala Bogor FC di Liga 3.
Di tahun 2019, karir Jan Saragih melonjak ke Liga 1. Ia menjadi pelatih Badak Lampung FC.
Setelah itu Jan Saragih resmi menjadi Kepala Departemen Football Performance PSS Sleman tahun 2021-2022.
Jan Saragih dipercaya PSS Sleman bertugas untuk membantu tim pelatih dari segi menganalisis performa pemain Super Elang Jawa.
Terakhir ia menangani kembali tim kontestan di Liga 1 2022/2023 yakni Persik Kediri yang saat ini harus menjadi pelatih Askar Bertuah.(*)
