Lionel Nathan juga mencoba peruntungannya untuk masuk ke Timnas Indonesia U-17 sebelum bergabung dengan akademi PSG.
Ia mengikuti seleksi terbuka di Surabaya dan berhasil masuk dalam 50 besar untuk melanjutkan seleksi di Jakarta.
Lionel Nathan tidak memenuhi kriteria pelatih Timnas Indonesia U-17, Bima Sakti, sehingga ia tidak dapat mewakili Indonesia dalam ajang tersebut.