Selain itu, PSSI menyebut ada hubungan kurang harmonis antara pelatih dengan pemain naturalisasi. Terdapat isu mengenai kurang harmonisnya hubungan antara Shin Tae-yong dengan beberapa pemain keturunan atau naturalisasi, yang diduga mempengaruhi performa tim.
PSSI juga sempat membahas soal evaluasi kinerja. Meskipun berhasil membawa Indonesia ke babak ketiga kualifikasi Piala Dunia 2026 dan meraih kemenangan penting, seperti mengalahkan Arab Saudi 2-0 pada November 2024, PSSI merasa perlu adanya perubahan untuk meningkatkan peluang lolos ke Piala Dunia.
Sebagai penggantinya, PSSI menunjuk Patrick Kluivert, mantan pemain tim nasional Belanda, sebagai pelatih baru Timnas Indonesia.