Fermentasi adalah proses mengubah karbohidrat dalam bahan makanan menjadi asam organik dengan menggunakan mikroorganisme. Dalam industri fermentasi, keberadaan jamur sangat menentukan keberhasilan produk. Salah satu jamur berasal dari ragi yaitu Saccaromyces ceriviceae. Contoh hasil fermentasi adalah bir, roti, tape, dan tempe.
3. Sebagai obat
Walau ada beberapa jamur yang menyebabkan penyakit, ternyata ada juga jamur yang bisa dijadikan obat. Salah satunya adalah Ganoderma lucidum. Jamur ini disebut juga ling zhi berkhasiat sebagai obat herbal antidiabetes, antihipertensi, antialergi, antioksidan, antihepatitis, analgesik, anti-HIV, serta perlindungan terhadap liver, ginjal, hemoroid atau wasir, antitumor, dan sistem imunitas (kekebalan tubuh).
Selain itu juga ada jamur Penicillium notatum yang dibuat menjadi obat antibiotik yaitu penisilin yang berguna untuk obat alergi.
4. Sumber makanan bagi manusia
Benerapa jenis jamur tertentu umum dimasak dalam sup atau bahkan sebagai keripik. Jamur-jamur yang biasanya dijadikan sebagai makanan adalah Auricularia polytricha (jamur kuping), Volvariella volvaceae (jamur merang), dan Pleurotes (jamur tiram).