Infografis
Setelah itu, ia masuk ke Madrasah Tsanawiyah Pesantren Sidogiri di Pasuruan (1987-1990), dan Madrasah Aliyah Al Miftah di Pamekasan, Madura (1990-1993). Selanjutnya ia meneruskan pendidikan di Lembaga Ilmu Pengetahuan Islam dan Arab, Jakarta dan meraih gelar Lc.
Di tahun yang sama ia meraih gelar Lc, Kiai Cholil meraih gelar S.Ag dari Sekolah Tinggi Agama Islam Az-Ziyadah Jakarta. Ia lalu menyelesaikan program pascasarjana di Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta dengan gelar M.A
Pada 2008, Kiai Cholil melanjutkan pendidikan di Universitas Malaya, Malaysia dan meraih gelar Ph.D.
Tak hanya pendidikan formal, ia juga mengikuti berbagai program pendidikan non-gelar bersertifikat. Kyai Cholil juga pernah mengikuti Short Course Education Management di Universitas Leeds, UK (2005), Short Course di Universitas Nasional Singapura (2009), dan Short Course Islamic Economic di International Mustafa University Qom, Iran (2011).
Selain itu, ia juga pernah menjadi visiting scholar di Universitas Oxford, Inggris. Memiliki latar pendidikan yang moncer ini, Kiai Cholil aktif menerbitkan banyak tulisan serta karya ilmiah.
Berikut karya Kiai Cholil di Jurnal Ilmiah
- Format Bernegara Dalam Islam (Jurnal Kajian Timur Tengah dan Islam, volume IV/2000 – 2001)
- Islam dan Pluralisme di Indonesia (Ad-Da’wah, volume 2 No 2, Februari 2005)
- Corak Pemikiran Hukum Ekonomi Islam di Indonesia (Ad-Da’wah, volume 3 No. 1, Agustus 2005)
- Posisi Akal Dalam Menetapkan Hukum Islam (Ad-Da’wah, volume 3 No. 2, Februari 2006)
- Wakaf Sebagai Jaminan Sosial (Al-Awqaf, volume 2, Oktober 2009)
- Aplikasi Wakaf Uang di Indonesia (Al-Awqaf, volume IV, No. 02 Juli 2011)
- Peranan MUI dan Metode Istinbat Fatwa dalam Undang-undang Perbankan Syariah di Indonesia (Jurnal Pengurusan, volume 35, September 2012 Universiti Kebangsaan Malaysia Press)
- Syariah Banking Law and Fatwa (Islamic Legal Institution) in Indonesia (Jurnal of International Banking Law and Regulation, Volume 28 Mei Issue 12 Tahun 2013)
- Penyerapan Fatwa ke dalam Undang-Undang Perbankan Syariah di Indonesia (Jurnal Middle East and Islamic Studies”, Volume 3 Nomor 6 Juli-Desember 2014 – MEIS)
