Terpisah, Seto dinilai cukup sukses menukangi skuat Super Elja. Menjadi pelatih kepala PSS sejak berlaga di gelaran Liga 2 2018, mantan pemain PSIM Yogyakarta itu berhasil mengantarkan Bagus Nirwanto dan kawan-kawan melenggang ke kasta tertinggi sepak bola Indonesia musim selanjutnya.
Hingga kini, PSS masih bertengger di papan atas klasemen sementara yakni di peringkat kelima. Super Elja mengemas 35 poin dari 23 pertandingan Liga 1 2019.