Meski begitu, tercatat bahwa Sayuti Melik menentang usulan pengangkatan Soekarno menjadi presiden seumur hidup oleh MPRS kala itu. Selain itu, ia juga memiliki pemikiran yang berseberangan dengan Soekarno.
Soekarno kala itu menggagas usulan tentang Nasakom yang terdiri dari nasionalisme, agama, dan komunisme. Sayuti Melik menentangnya dan mengusulkan mengganti Nasakom menjadi Nasasos atau sosialisme.
Hal ini lantaran, saat waktu itu, Sayuti Melik melihat PKI berusaha memanfaatkan kharisma Soekarno untuk masuk ke dalam pemerintahan.