Sepanjang karirnya sebagai seorang misionaris, Romo Magnis banyak memberi prasaran dan ceramah, ia juga kerap muncul dalam talkshows di TV dan aktif dalam dialog antar agama.
Hingga saat ini, Romo Magnis telah menulis lebih dari 700 karangan populer maupun ilmiah serta 44 buku, kebanyakan dalam bahasa Indonesia, terutama di bidang etika, filsafat politik, alam pikiran Jawa dan filsafat ketuhanan.