Namun, perjalanan karir Denny Indrayana tak lepas dari kontroversi. Beberapa kasus hukum yang menjeratnya, seperti kasus dugaan korupsi proyek Payment Gateway di Kementerian Hukum dan HAM, sempat menjadi sorotan publik. Meskipun demikian, ia selalu membantah tuduhan tersebut dan menganggapnya sebagai kriminalisasi.
Setelah tidak lagi menjabat di pemerintahan, Denny kembali aktif sebagai pengacara dan akademisi. Ia mendirikan firma hukum dan memberikan kuliah di berbagai universitas. Selain itu, ia juga aktif memberikan komentar dan kritik terhadap isu-isu hukum dan politik terkini melalui media sosial dan berbagai platform lainnya.
Denny Indrayana dikenal sebagai sosok yang vokal dan kritis. Ia tak segan menyampaikan pandangannya, bahkan jika itu berseberangan dengan arus utama. Hal ini membuatnya menjadi figur yang kontroversial, namun juga dihormati oleh sebagian kalangan karena keberaniannya dalam menyuarakan kebenaran.
Kiprahnya di dunia hukum dan politik Indonesia terus menjadi perhatian publik, dan ia tetap menjadi salah satu tokoh yang berpengaruh dalam perdebatan isu-isu krusial di Indonesia.