Setelah perintah pengadilan tinggi pada tahun 2008, CBI memperbarui penyelidikannya dan menangkap serta menuntut Kottoor, Sephy, dan Pastor Jose Poothrikkayil, tetapi mereka dibebaskan dengan jaminan.
"Kasus Suster Abhaya akhirnya mendapatkan keadilan. Dia akan beristirahat dengan damai," kata aktivis hak asasi manusia Jomon Puthenpurackal, yang telah berkampanye untuk putusan atas pembunuhan tersebut.