Kemudian melanjutkan studi S-2 di bidang Ilmu Politik di Universitas Padjadjaran. Pada 2015, ia meraih gelar doktor di bidang Hubungan Internasional dari universitas yang sama.
Dipecat PDIP
Surat Keputusan atau SK pemecatan Effendi Simbolon dari PDIP ditandatangani langsung oleh Ketua Umum PDIP Megawati Soekarnoputri dan Sekretaris Jenderal PDIP Hasto Kristiyanto.
"Menetapkan: 1. Memberikan sanksi organisasi berupa pemecatan kepada Effendi Muara Sakti Simbolona dari kenaggotaan Partai Demokrasi Indonesia Perjuangan," bunyi kalimat dalam SK.
Diketahui, Effendi Simbolon menjadi sorotan usai tampak ikut mendukung pasangan cagub-cawagub Ridwan Kamil-Suswono di Pilkada Jakarta belum lama ini.
Ia terlihat hadir menemani Presiden ke-7 RI Jokowi turun kampanyekan RK-Suswono beberapa waktu lalu.