Hingga puncaknya di tahun 2014, ia dipilih sebagai Ketua DPR RI periode 2014-2019. Setahun menjabat, Novanto dilaporkan atas kasus 'Papa Minta Saham' Freeport ke MKD DPR. Ia lantas memutuskan untuk mengundurkan diri dari jabatannya.
Meski tersandung kasus, kiprahnya di dunia politik tak terhenti. Novanto kembali terpilih sebagai Ketua Umum DPP Golkar periode 2016-2019. Ia pun kembali dilantik menjadi Ketua DPR RI 2016-2019.
Terakhir, kasus korupsi e-KTP menyeret Novanto menjadi tahanan KPK dan selama proses persidangan, Novanto mundur dari jabatannya sebagai Ketua Umum DPP Golkar dan Ketua DPR RI. Pada April 2018, Novanto pun divonis bersalah dan menjalani hukum 15 tahun penjara.