Namun, jengkol juga mengandung senyawa yang dapat menyebabkan bau mulut dan gas usus yang tidak sedap. Oleh karena itu, konsumsilah jengkol dengan bijak dan jangan berlebihan. Jangan lupa untuk mencuci jengkol dengan baik sebelum dimasak, dan hindari mengonsumsi jengkol mentah atau setengah matang, karena dapat menyebabkan keracunan.