Menurut sebuah makalah ulasan pada 2003 di Lancet, jaringan limfatik di usus mengandung kumpulan sel terbesar yang mampu menghasilkan respons imun.
Sebuah studi 2012 menemukan pemberian ASI atau susu formula dapat memengaruhi komposisi bakteri di usus, yang pada akhirnya berdampak pada sistem kekebalan mereka.
Bayi yang hanya diberi ASI memiliki lebih banyak keragaman bakteri usus dibandingkan yang mengonsumsi susu formula.