Penyelenggaraan Piala Dunia U-20 ini menimbulkan polemik karena masuknya Israel, sebagai salah satu peserta. Sejumlah pihak menolak kehadiran Israel di tanah air.
Ganjar Pranowo yang saat itu masih menjabat sebagai Gubernur Jawa Tengah, adalah salah satu pihak yang menolak Israel menginjakkan kaki di Indonesia.
Alasannya karena Indonesia tidak punya hubungan diplomatik dengan Israel dan juga Israel dianggap sebagai negara yang menjajah Palestina.
Polemik terus bergulir hingga akhirnya FIFA memutuskan membatalkan Indonesia sebagai tuan rumah Piala Dunia U-20 dan menunjuk Argentina sebagai penggantinya.