Meski dikenal sebagai politikus, Raja Juli ternyata mempunyai latar belakang pendidikan sebagai seorang santri. Raja Juli merupakan alumni Pondok Pesantren Darul Arqam Muhammadiyah, Garut, Jawa Barat.
Dia meraih gelar sarjana Ilmu Al-Qur'an dan Tafsir dari IAIN Syarif Hidayatullah (UIN Jakarta) pada tahun 2001. Kemudian melanjutkan pendidikan magister di The Department of Peace Studies, Universitas Bradford, Inggris. Gelar doktoralnya diraih di School of Political Science and International Studies, Universitas Queensland, Australia.