Dari pernikahan pertamanya itu, Idayati punya 2 orang anak. Kedua anak Idayati itu bernama Septiara Silvani Putri dan Adityo Rimbo Galih. Menurut sumber, Septiara Silvani Putri telah menikah dengan Joko Priyambodo.
Diketahui saat ini Idayati tinggal di Solo, Jawa Tengah. Selain sibuk jadi ibu rumah tangga, Idayati aktif dalam beberapa kegiatan sosial.
Perkenalan Idayati dan Anwar Usman terjadi pada Oktober 2021 lalu. Idayati mengaku dikenalkan oleh seorang teman dengan ketua MK itu. Pernikahan keduanya pada 26 Mei 2022 lalu bertepatan saat Idayati merayakan ulang tahun ke-56.